Flip Klijn is wetenschappelijk onderzoeker op het Institute for Economic Analysis (IAE-CSIC) in Barcelona. Daarnaast is hij verbonden aan de Barcelona Graduate School for Economics. Zijn onderzoeksgebied is speltheorie, en in het bijzonder de theorie en de toepassingen van bilaterale toewijzingsproblemen (matching theory). Zijn onderzoeksresultaten werden gepubliceerd in o.a. American Economic Review en Journal of Economic Theory. In academisch jaar 2009-2010 was hij, op uitnodiging van Al Roth, research fellow op Harvard Business School.